Drie nieuwe Europese projecten onderzoeken systeembiologie met ERASy..
15 juli 2015
Drie projecten gaan onderzoek doen naar toegepaste aspecten van systeembiologie. Deze drie vormen het Nederlandse onderdeel van Europese consortia binnen ERASysAPP.
ERASysAPP is een ERA-net van tien Europese landen dat toegepaste aspecten van systeembiologie wil versterken. De call was gericht op systeembiologisch onderzoek aan micro-organismen, planten en dieren binnen de levenswetenschappen en biotechnologie.
In deze call van ERASysAPP ontvangen vijf projecten, waarvan drie met Nederlandse inbreng, financiering. Europese onderzoeksconsortia dienden in totaal tien voorstellen in, waarvan zeven met Nederlandse inbreng. De Nederlandse inbreng van deze drie projecten heeft een gezamenlijke waarde van
een half miljoen euro. ALW financiert de Nederlandse bijdrage aan deze tweede gezamenlijke call als onderdeel van de internationale samenwerking van ALW.
XyloCut: Shortcut to the carbon efficient microbial production of chemical building blocks from lignocellulosederived D-xylose
Dr.ing. S.A. Wahl, TUD, met partners uit Duitsland en Zweden
Tweede generatie biomassa bevat verschillende suikers. Algemeen gebruikte micro-organismen zoals de gist Saccharomyces cerevisiae en Corynebacterium glutamicum kunnen een deel van de suikers gebruiken. Vooral xylose, dat veel voorkomt in biomassa, kan door deze micro-organismen niet worden
omgezet. Met enzymen van een andere bacterie, C. crescentus, passen we een nieuwe route voor gebruik van xylose toe. Deze route kan gebruikt worden voor bijvoorbeeld de productie van succinate of 1,4-butaandiol uit hernieuwbare tweede generatie biomassa.
SYSTERACT - Systematic Rebuilding of Actinomycetes for Natural Product Formation
Prof. dr. G. van Wezel (UL), met partners uit Duitsland, Noorwegen en Zweden
De snel toenemende resistentie van ziekteverwekkende bacterien tegen antibiotica vormt een groot probleem voor de volksgezondheid; nieuwe antibiotica zijn hard nodig. In het DNA van Streptomyces bacterien liggen veel genen voor antibiotica die niet of slecht tot expressie komen, de zogenaamde
slapende antibiotica. Het SysterAct consortium gaat met systeembiologische benadering en modellering een `super-gastheer' maken. Die moet in staat zijn om deze nieuwe antibiotica aan te zetten, te karakteriseren en te produceren.
ROBYSTYEAST - Optimizing metabolic regulation in yeast production strains for dynamic conditions
Prof.dr. F. Bruggeman (VU), met partners uit Zwitserland en Duitsland
Bakkersgist wordt veel gebruikt in de biotechnologie. Dit micro organisme wordt dan in grote bioreactoren gegroeid, waar het aan sterk varierende condities wordt blootgesteld. In dit project, onderzoeken we met experimentele en theoretische benaderingen de robuustheid van bakkersgist in
dergelijke dynamische condities.
Bron: NWO