Small regulatory RNAs: identification, classification and utilization
Datum: 11 april 2011
Promotie: dhr. E. Seinen, 16.15 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Small regulatory RNAs: identification, classification and
utilization
Promotor(s): prof.dr. O.C.M. Sibon, prof.dr. R.C. Jansen
Faculteit: Medische Wetenschappen
Computerprogramma maakt genetisch onderzoek nauwkeuriger
Voor veel genetisch onderzoek wordt gebruik gemaakt van de techniek RNA
interferentie (RNAi). Hiermee kunnen specifieke genen worden
uitgeschakeld. RNAi wordt helaas ook geplaagd door zogenaamde
`off-targets', waarbij per ongeluk de verkeerde genen worden
uitgeschakeld. Erwin Seinen ontwikkelde software die helpt om deze
problemen te ondervangen.
Seinen ontdekte dat het aantal potentiële off-targets voor
RNAi-moleculen soms verrassend hoog is, wat kan leiden tot foute
interpretaties van onderzoeksgegevens. Bestaande methodes om
off-targets te voorkomen hebben ernstige tekortkomingen, zo toont
Seinen verder aan.
Hij ontwikkelde een nieuw computerprogramma, RNAi-Select genaamd, dat
het aantal off-targets reduceert door met grote precisie genomische
sequenties te analyseren en met die informatie unieke RNAi-moleculen te
ontwerpen. Het programma kan ook helpen bij het identificeren van
endogene miRNAs die geassocieerd zijn met ziektes, zo laat Seinen zien.
Hij illustreert beide mogelijkheden aan de hand van, respectievelijk,
onderzoek naar de ziekten PKAN en Hodgkin's lymphoma.
Erwin Seinen (Leeuwarden, 1978) studeerde biologie aan de
Rijksuniversiteit Groningen. Hij verrichtte zijn onderzoek aan de
afdeling Celbiologie van het Universitair Medisch Centrum Groningen
(UMCG). Het onderzoek werd medegefinancierd door NWO. Seinen heeft zich
inmiddels als zelfstandig biotech-ondernemer gevestigd in Groningen.
Laatst gewijzigd: 05 april 2011 10:59
Rijksuniversiteit Groningen