Universiteit van Amsterdam


Promotie: Rol micro-organismen bij processen in kustsedimenten soms groter dan bekend


Promotie Biologie

dinsdag 25 januari, 12.00 uur

Micro-organismen zoals bacteriën en microalgen vormen een zeer diverse groep in natuurlijke ecosystemen en spelen een centrale rol in vele processen in de elementencycli. Tetsuro Miyatake wilde verbanden aantonen tussen de microbiële soortensamenstelling en de biogeochemische processen in kustsedimenten. Ze deed dit door middel van het labelen van 16S rRNA met het stabiele isotoop 13C (stable isotope probing; SIP). SIP, een verzameling van technieken waarbij biomarkers worden gelabeld met stabiele isotopen, biedt de mogelijkheid om tegelijkertijd micro-organismen te identificeren (de biomarker) en hun metabolische activiteiten te karakteriseren (label-opname). Miyatake ontwikkelde een SIP-methode die gebruik maakt van oligonucleotide probes en paramagnetische bolletjes om het 16S rRNA van specifieke fylogenetische groepen te isoleren. Die heeft hij vervolgens geanalyseerd op de isotopensamenstelling. Miyatake verkreeg gedetailleerde informatie over de micro-organismen die betrokk en zijn bij een aantal belangrijke processen in kustsedimenten. Van een aantal groepen toonde hij aan dat hun rol breder is dan algemeen werd aangenomen. Dhr. T. Miyatake: Linking microbial community structure to biogeochemical function in coastal marine sediments. Stable isotope probing combined with magnetic bead capture. Promotor is dhr. prof. dr. L.J. Stal.
Locatie: Agnietenkapel, Oudezijds Voorburgwal 231, Amsterdam.