Puzzling structures enlightened. A structural survey of large protein
complexes
Datum: 14 juni 2010
Promotie: dhr. J.B. Bultema, 13.15 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Puzzling structures enlightened. A structural survey of
large protein complexes
Promotor(s): prof.dr. E.J. Boekema
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Supercomplexen in beeld
Jelle Bultema bepaalde de structuur van deze eiwitcomplexen met behulp
van transmissie-elektronenmicroscopie en beeldverwerking. Het doel was
om vervolgens de subunits te lokaliseren. Met deze informatie zijn
eiwit-eiwit interacties beter te begrijpen.
In een hoofdstuk beschrijft Bultema de structurele karakterisering van
gedeeltelijk geïsoleerde mitochondriële supercomplexen. Dit leverde
verschillende aanzichten op van een vijftal supercomplexen. Aan de hand
van de lokalisatie van individuele complexen binnen een supercomplex
stelt hij een structureel model van het grootste supercomplex op.
In twee volgende hoofdstukken beschrijft hij verschillende aspecten van
Vipp1 van Synechocystis PCC 6803. Het is zowel gelokaliseerd in het
cytoplasma, bij het cytoplasmatisch membraan en het thylakoid membraan.
Bultema: 'Wij bewezen dat Vipp1 naast dimeren ook grotere structuren
vormt. Het tegelijkertijd bestaan van meerdere Vipp1 ringstructuren is
uitzonderlijk en suggereert een speciale rol voor dit eiwit.'
Het tweede deel beschrijft een vergelijking met Vipp1's bacteriële
homoloog Phage Shock Protein A (PspA). Beide eiwitten hebben dezelfde
secondaire structuur en vormen elk grote homo-oligomere ringstructuren,
echter, de afmetingen van deze ringen verschillen aanzienlijk. Dit
gedeelte eindigt met de presentatie van een ruimtelijk model voor de
waargenomen Vipp1 ringen. Het laatste eiwit beschrijft de biochemische
en biofysische karakterisering van een RNA-eitwit complex genaamd
Cascade. Dit multi-eiwit complex is onderdeel van het zogenaamde CRIPSR
immuun systeem van prokaryoten. Zij gebruiken kleine stukken RNA voor
het neutraliseren van binnendringende virussen. Voor Cascade
presenteert Bultema de samenstelling, eiwit stoichiometrie en lage
resolutie structuur en demonstreert hoe het DNA herkent.
Jelle Bultema (Delfzijl, 1980) studeerde scheikunde in Groningen. Het
onderzoek werd uitgevoerd bij de afdeling Elektronenmicroscopie van de
RUG.
Laatst gewijzigd: 08 juni 2010 09:45
Rijksuniversiteit Groningen