Structural investigations of three different proteins by X-ray
crystallography and NMR
Datum: 16 april 2010
Promotie: dhr. A. Kale, 13.15 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Structural investigations of three different proteins by
X-ray crystallography and NMR
Promotor(s): prof.dr. B.W. Dijkstra
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Structuur-functieonderzoek aan drie eiwitten
Kennis van de drie-dimensionale structuur van eiwitten is essentieel
om de werking van biologische systemen te kunnen begrijpen. Twee
belangrijke experimentele technieken om in atomair detail
structuurinformatie te verkrijgen, zijn röntgenkristallografie en
kernspinresonantie (NMR).
Hoewel beide methoden structuren van hoge kwaliteit kunnen opleveren,
heeft elke techniek zijn eigen beperkingen en hindernissen.
Röntgenkristallografie is afhankelijk van kristallen die
röntgenstraling verstrooien, terwijl NMR-methoden meestal alleen
toepasbaar zijn op kleine eiwitten. Bij beide technieken moet het
eiwitpreparaat homogeen, stabiel en redelijk tot goed oplosbaar zijn,
en het eiwit mag niet irreversibel aggregeren bij hoge concentraties.
Zelfs als aan al deze voorwaarden is voldaan, is dat geen garantie dat
deze methoden zullen werken. Een succesvolle structuurbepaling is
afhankelijk van vele factoren die van eiwit tot eiwit kunnen
verschillen.
Het proefschrift van Avinash Kale beschrijft structurele en
functionele studies van drie verschillende eiwitten, uitgevoerd met
behulp van röntgenkristallografie en NMR in combinatie met andere
biochemische methoden. Het is verdeeld in drie delen: het eerste deel
beschrijft de structuur en functie van leucine aminopeptidase, ppLAP,
uit Pseudomonas putida, het tweede deel bevat structurele en
functionele studies van het competentie-gerelateerde adaptor eiwit
MecA uit Bacillus subtilis en het derde deel beschrijft
structuur-functieonderzoek dat is uitgevoerd aan het SWAP-70 eiwit uit
de muis, een eiwit dat in de literatuur is beschreven als een nieuw
type 'guanine-exchange' factor.
Avinash Kale (India, 1976) studeerde fysische chemie aan het Indian
Institute of Technoloy in Mumbai. Het onderzoek werd uitgevoerd bij
het Laboratory of Biophysical Chemistry van de RUG en gefinancierd
door ZonMw. Kale gaat door in het onderzoek als postdoc aan de
University of Sheffield.
Laatst gewijzigd: 06 april 2010 09:27
Rijksuniversiteit Groningen