A proteomics approach to inner membrane biogenesis in Escherichia coli
Datum: 26 februari 2010
Promotie: mw. C.E. Price, 16.15 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: A proteomics approach to inner membrane biogenesis in
Escherichia coli
Promotor(s): prof.dr. A.J.M. Driessen
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Proteomics en membraaneiwitbiogenese in Escherichia coli
Claire Price bestudeerde de rol van Escherichia coli YidC in
membraaneiwitbiogenese, en dan met name van de subeenheden van
respiratie-eiwitcomplexen. Een gerichte proteomics aanpak is gebruikt
om het effect van YidC-depletie op componenten van de anarobe
elektronentransportsystemen te achterhalen. Hieruit is gebleken dat
YidC-depletie onder deze omstandigheden een forse groeivermindering
veroorzaakt en dat een aantal respiratiecomplexen negatief werd
beïnvloed. Dit is breder onderzocht met metabolic labeling met 15N/14N
om alle membraanproteome veranderingen na YidC-depletie onder zowel
aerobe als anaerobe omstandigheden te achterhalen. Dat leidde tot de
identificatie van mogelijke YidC-substraten. Vervolgens werden de in
vitro insertievereisten van subeenheid K van complex I
gekarakteriseerd. Het is duidelijk geworden dat NuoK zowel Sec
translocase als YidC nodig heeft voor membraaninsertie. In de membraan
aanwezige negatieve ladingen in NuoK zijn verantwoordelijk voor de
YidC-afhankelijkheid van dit eiwit. Met gebruikt van de
mechanosensitieve kanaal MscL, is het ook bewezen dat in vitro
translatie en membraan insertie systemen kunnen worden geëxploiteerd
om actieve oligomeric eiwit complexen buiten de cel te produceren.
Omdat het bewezen is dat YidC een interactie heeft met het
SecDFYajC-complex, is het effect van SecDFYajC-depletie op de
membraanproteome van E. coli ook onderzocht. De bevindingen worden
bedicussieerd in de context van de huidige kennis van de
Oxa1/Alb3/YidC familie van eiwitten en dan met name de diverse
functies van YidC in membraaneiwitbiogenese in E. coli.
Claire Price (Zuid-Afrika, 1980) studeerde aan de universiteit van
Kaapstad en deed haar promotieonderzoek aan de Rijksuniversiteit
Groningen bij de afdeling Moleculaire microbiologie van het Groningen
Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute. Haar onderzoek werd
gefinancierd door het Netherlands Proteomics Centre. Inmiddels werkt
zij als postdoc bij de afdeling Genetics and Biochemistry van de RUG.
Laatst gewijzigd: 16 februari 2010 11:21
Rijksuniversiteit Groningen