Stichting FOM

Meer informatie Contactperso(o)n(en): Gabby Zegers 13 oktober 2009

Moleculaire motor schakelt door mechanische terugkoppeling

Onderzoekers van het FOM-instituut AMOLF hebben een wiskundig model ontwikkeld dat tot in detail kan verklaren waarom de moleculaire motor die de zweephaar van een bacterie aandrijft een sterke voorkeur heeft om na een vaste periode van draairichting te wisselen. Dit schakelen van de motor blijkt niet alleen gestuurd te worden door boodschappermoleculen, zoals tot nu toe werd aangenomen, maar ook door de mechanische terugkoppeling van de zweephaar op de motor. De onderzoekers publiceren hun resultaten volgende week in het tijdschrift Molecular Systems Biology. Ondanks vele patenten is de mens niet het enige organisme dat gebruikmaakt van motoren. Verschillende soorten bacteriën, waaronder de in onze dikke darm woonachtige Escherichia colibacterie, bewegen zich voort met behulp van zweepstaartjes, elk aangedreven door zijn eigen minuscule elektromotor. Terwijl de structuur van de motor grotendeels bekend is, wordt over de werking nog veel gespeculeerd. In recente experimenten is het schakelgedrag van de motor voor het eerst nauwkeurig bestudeerd en op basis daarvan is nu een wiskundig model ontwikkeld dat zowel het draaien als het schakelen van de motor beschrijft. Figuur 1. Moleculaire schakelaar
vergroten Figuur 1. Moleculaire schakelaar
De bacteriële motor bestaat uit een aantal statoreiwitten dat een ring van eiwitten genaamd de rotor aandrijft; de rotor kan zowel links- als rechtom draaien en stuurt de zweephaar (flagellum) aan. Uit recente experimenten is gebleken dat de motor een sterke voorkeur heeft om na een vaste periode van 0,2 tot 0,3 seconden van draairichting te wisselen. Onderzoekers van het FOM-instituut AMOLF hebben een model ontwikkeld voor het draaien en schakelen van de motor waarmee ze laten zien dat het af- en opwikkelen van de zweephaar verantwoordelijk is voor deze voorkeursschakeltijd.
Bacteriemotoren
Een bacteriemotortje heeft twee versnellingen: een vooruit en een achteruit. Wanneer alle motoren in hun vooruit staan vormen de zweepstaartjes een bundel die de bacterie voortstuwt. Wanneer de zwemrichting niet bevalt, bijvoorbeeld door een afnemende hoeveelheid voedsel, zorgen boodschappermoleculen ervoor dat een of meerdere motoren even in hun achteruit worden gezet met als gevolg dat de desbetreffende zweepharen de bundel verlaten en de bacterie een tuimeling maakt. De bacterie zwemt vervolgens verder in de toevallige richting waarin hij is uitgekomen. De motoren van de bacterie zijn populaire onderzoeksobjecten, niet alleen omdat ze zo onwaarschijnlijk klein zijn - de rotor (het ronddraaiende gedeelte) bestaat uit een ring van slechts 26 eiwitmoleculen - maar ook omdat de efficiëntie van de motor vrijwel 100% is. De energiebron van de motor bestaat uit protonen die continu de cel in worden gestuwd door een verschil in zuurtegraad. De statorelementen van de motor (de stilstaande delen) veranderen van vorm door het binden van de protonen en duwen zo de rotor rond. Ook de rotoreiwitten kunnen van vorm veranderen; dit correspondeert met het schakelen van de motor tussen de vooruit- en de achteruitversnelling.

Het schakelen van de motor
In recente experimenten werd verrassenderwijs gevonden dat de motoren een sterke voorkeur hebben om te schakelen na een vaste periode van 0,2 tot 0,3 seconden. Onderzoekers van het FOM-instituut AMOLF hebben een wiskundig model ontwikkeld dat deze observatie tot in detail kan verklaren. Een belangrijke voorspelling van het model is dat de motor een grotere kans heeft van draairichting te veranderen wanneer er een grotere externe kracht op wordt uitgeoefend. Deze ingrediënt, in combinatie met de elastische eigenschappen van de zweephaar, is volgens de onderzoekers verantwoordelijk voor de karakteristieke schakeltijd van de motor. Wanneer de motor net van richting is veranderd, begint de spiraalvormige zweephaar zich aanvankelijk af te wikkelen, en neemt de kracht op de motor af. Vervolgens wikkelt de zweephaar zich echter op in de nieuwe richting en neemt de kracht, en daarmee de kans om van richting te veranderen, toe. Na 0,2 tot 0,3 seconde is de kracht op de motor dusdanig groot geworden dat de motor snel weer van richting verandert. Het schakelen van de motor wordt dus niet alleen gestuurd door boodschappermoleculen, zoals tot nu toe werd aangenomen, maar ook door de mechanische terugkoppeling van de zweephaar op de motor.
Voor de redactie:

Referentie
'The switching dynamics of the bacterial flagellar motor', Siebe van Albada, Sorin Tanase-Nicola, en Pieter Rein ten Wolde, Molecular Systems Biology http://www.nature.com/msb/

Contact
Pieter Rein ten Wolde, telefoon 020 - 754 72 81, Melissa van der Sande, telefoon 020 - 754 72 34.