Receptor-like kinases. Proteome, dynamics and function
Datum: 03 juli 2009
Promotie: H. Najafi Zarrini, 11.00 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Receptor-like kinases. Proteome, dynamics and function
Promotor(s): prof.dr. J.T.M. Elzenga
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Veranderingen in signaaltransductie-eiwitten in de plant bij
verzilting
Najafi Zarrini onderzocht veranderingen in bepaalde eiwittten, de
receptor-like kinases, uit de plasmamembraan van planten die zijn
blootgesteld aan zout. Receptor-like kinases (RLK's) zijn belangrijke
signaaltransductie-eiwitten. Slechts weinig RLK's zijn
gekarakteriseerd, maar wel is bekend dat ze een belangrijke rol spelen
in de plant. In planten behoren RL- genen tot één grote genfamilie,
die zo'n drie procent van het genoom van Arabidopsis (zandraket) in
beslag neemt. Om de functie van al deze receptoren te kunnen bepalen
zou men het liefst zo veel mogelijk receptoren in één keer willen
kunnen aantonen en bestuderen. Massaspectrometrie (MS) maakt dat
mogelijk.
Verzilting van landbouwgronden is een wereldwijd probleem. Het
blootstellen van planten aan zout leidt tot verandering van de
eiwitsamenstelling van de plasmamembraan. Met behulp van MS kon
Zarrini meer dan 900 eiwitten detecteren. Hieronder bevonden zich 69
RLK's. Door blootstelling aan zout ging het niveau van 46 eiwitten
(waaronder 1 RLK) omhoog en van 32 (waaronder 5 RLK's) omlaag. Verder
karakteriseerde hij tien RLK's, met behulp van mutanten. Slechts een
van deze mutanten vertoonde een fenotype. De hoofdwortel was korter en
het wortelstelsel vertoonde meer zijwortels. Dit fenomeen werd
versterkt onder osmotische stress. De betrokken RLK noemde hij
Branching Inhibiting Receptor 1 (BIR1).
Door gebruik te maken van een conservatief deel van de kinase (het
subdomein VIb van het kinase domein van alle Leucine-rich repeat RLKs)
als antigen, kon een antilichaam worden ontwikkeld, waarmee de
dynamiek van een groot aantal RLKs in één experiment kan worden
bestuderen. Met behulp van dit antilichaam kon Zarrini veranderingen
zichtbaar maken in planten die op zout waren gegroeid.
Najafi Zarrani (Iran, 1969) studeerde plantenteelt aan de Iraanse
University of Shiraz. Zijn promotieonderzoek verrichtte hij aan de RUG
bij het Laboratorium voor Plantenfysiologie, onderdeel van het Centre
for Ecological and Evolutionary Studies (CEES) en bij de
onderzoeksgroep Membrane Enzymology van het Biomolecular Sciences and
Biotechnology Institute (GBB). Zarrani keert terug naar zijn
voormalige werkgever in Iran, de Sari Agricultural Sciences and
Natural Resources University (SANRU).
Laatst gewijzigd: 18 juni 2009 12:54
Rijksuniversiteit Groningen