Technische Universiteit Delft
Kanker in beeld
door M&C
Promotie van dhr. B.J. Vermolen: "Nuclear Architecture: Image
Processing and Analyses"
13 februari 2009 | 10:00 uur
plaats: Aula TU Delft
De heer Ir. B.J. Vermolen | natuurkundig ingenieur, Nederland
promotor 1 | Prof.dr. I.T. Young TNW
promotor 2 | Prof.dr. Y. Garini Bar-Ilan U., Israël
Nuclear Architecture: Image Processing and Analyses
Kanker is één van de bekendste groepen ziektes die zijn oorzaak vindt
in afwijkingen in de chromosomen. Hoe en waarom deze afwijkingen
ontstaan is één van de meest belangrijke vragen in de moderne
moleculaire biologie. In de afgelopen twintig jaar is het duidelijk
geworden dat regulatie van de genen in de celkern gecorreleerd is met
de structuur van componenten, zoals telomeren, centromeren en
chromosomen , in de celkern. Met nieuwe microscopen, betere camera's
en nieuwe fluorescerende labels, is de vraag om alle beelden die
gemaakt kunnen worden te kunnen analyseren gestegen.
Het doel van dit proefschrift is het ontwikkelen van beeldverwerkings-
en analysemethoden voor drie dimensionale (3D) beelden gemaakt met
fluorescentiemicroscopie. Verschillende microscopie technieken worden
beschreven, evenals verschillende technieken om componenten in de
celkern zichtbaar te maken (hoofdstuk 2). In hoofdstuk 3 worden
verschillende deconvolutie methoden beschreven. Hoofdstuk 4 geeft twee
methoden om de componten in de beelden te segmenteren. Na segmentatie
kunnen we verschillenden analyses uitvoeren. In hoofdstuk 4 laten we
zien, na lokalisatie, dat de telomeren van lymfocyten van muizen
tijdens de G2 fase in de cel cyclus zich in een disk herdistribueren.
In hoofdstuk 5 geven we een nieuwe methode om de relatieve lengte van
telomeren te bepalen door de geïntegreerde intensiteit te meten in de
3D beelden. Gebruikmakend van deze informatie kunnen uitzonderlijk
hoge signalen gekenmerkt worden als samenklonteringen van de
telomeren. In hoofdstuk 6 worden de segmentatie en lokalisatie
technieken gebruikt om de radiale herdistributies van componenten te
meten in menselijke mesenchymale stam cellen.
Meer informatie?
Voor inzage in proefschriften van de promovendi kunt kijken in de TU
Delft Repository op: repository.tudelft.nl. TU Delft Repository is de
digitale vindplaats van openbare publicaties van de TU Delft.
Proefschriften zullen binnen een paar weken na de desbetreffende
promotie in de Repository te vinden zijn.
Laatst gewijzigd: 29 januari 2009