Ingezonden persbericht
PERSBERICHT
Hengelo, 24 juni 2008
Betagraphics en HP realiseren HPC-oplossing voor data analyse electronenmicroscopie LUMC
High Performance Computing heeft de toekomst
Streamers:
Lage kosten en snelle implementatie
Google Earth Map van de menselijke cel
Betagraphics, specialist in IT-infrastructuur heeft in nauwe samenwerking met de sectie electronenmicroscopie van de afdeling Moleculaire Cel Biologie van het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) met succes een pilotproject gerealiseerd op het gebied van decentrale High Performance
Computing (HPC). De onderzoekers beschikken nu over een direct en volledig autonoom systeem voor het analyseren van data afkomstig van electronenmicroscopen.
Van 2D naar 3D
Betagraphics installeerde een 56 CPU computing cluster met 2 terabyte data-opslag. Dit naar volle tevredenheid van Bram Koster, hoofd van de sectie electronenmicroscopie van de afdeling MCB bij het LUMC. Het HPC systeem is een nieuwe stap die computing met microscopie verbindt. Als je wilt doorgronden hoe een virusinfectie verloopt, moet je in de cellen kijken. Dit doen we met behulp van vier electronenmicroscopen. HPC stelt ons in staat grote aantallen beelden van geïnfecteerde cellen te verzamelen en ze vervolgens gedetailleerd in 2D, 3D en zelfs 4D in kaart te brengen. We creëren als het ware een Google Earth Map van de menselijke cel.
-Virtuele rekenmachines-
Virtuele rekenmachine
Koster: Als wetenschappelijk gebruiker zien wij het HPC-systeem als een snelle, virtuele rekenmachine. De snelheid is niet alleen fenomenaal, maar ook noodzakelijk voor ons type onderzoek. Voor het berekenen van een eiwitstructuur met specialistische software voor uit tienduizenden beelden verkregen met electronenmicroscopie is de inbreng van de onderzoeker essentieel. Hij of zij moet de parameters invoeren en de keuze voor bepaalde algoritmes voor de 3D reconstructie bepalen en beïnvloeden. Kostte het vroeger minimaal acht uur voor we het resultaat van één reconstructie hadden, nu duurt zo n berekening acht minuten. Het grote voordeel daarbij is dat wij nu bepaalde keuzen in de berekeningen sneller kunnen aanpassen.
Krachten gebundeld
Dick Kamphuis, consultant van HP, is erg te spreken over de samenwerking met Betagraphics: We hebben met succes onze krachten gebundeld: HP is marktleider in industriestandaard High Performance Computers en de kracht van Betagraphics ligt in systeemontwerp en projectrealisatie toegesneden op de situatie en de wensen van de klant.
Standaard hard- en software
Het concept van Betagraphics biedt een modulaire oplossing gebaseerd op Linux en andere open standaarden. Het systeem wordt voorgeconfigureerd en tot op applicatieniveau getest opgeleverd. Herbert Zwartscholten, accountmanager IT-infrastructuren van Betagraphics: De standaardisering zorgt voor lage kosten en een snelle implementatie. Dit creëert nu ook mogelijkheden voor organisaties met een klein ICT-budget.
---
Bijlage: foto
Albert Brouwers, directeur Betagraphics, draagt met een handdruk het Compute Cluster over aan Bram Koster, sectiehoofd electronenmicroscopie van het Leids Universitair Medisch Centrum. Motto: HPC heeft de toekomst.
a37100.gif
Noot aan de redactie:
Voor nadere informatie kunt u contact opnemen met Carolien de Jonge, afdeling Marketing en Communicatie van Betagraphics op telefoonnummer 074 243 42 45. Meer informatie vindt u ook op www.betagraphics.nl
Over Betagraphics
Betagraphics is gevestigd in Hengelo Ov en is gespecialiseerd in het leveren, implementeren, onderhouden en beheren van hoog beschikbare IT-infrastructuuroplossingen voor kritische toepassingen.
Over LUMC
Het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) streeft naar een continue verbetering van de kwaliteit van de gezondheidszorg en wil hierin zowel nationaal als internationaal een leidende rol blijven spelen. De kerntaken van het LUMC zijn onderzoek, onderwijs, patiëntenzorg, opleiding en bij- en nascholing. Het LUMC maakt deel uit van de Nederlandse Federatie van Universitair Medische Centra (NFU). De NFU is een samenwerkingsverband van de acht universitair medische centra (UMC s) in Nederland.
Foto :
Albert Brouwers, directeur Betagraphics, draagt met een handdruk het Compute Cluster over aan Bram Koster, sectiehoofd electronenmicroscopie van het Leids Universitair Medisch Centrum. Motto: HPC heeft de toekomst.
Betagraphics B.V.
Demmersweg 166
7556 BN Hengelo Ov
Tel. 074 243 42 45
Fax 074 243 84 99