2,3 miljoen voor Computational Life Sciences
18 april 2008
NWO-Exacte Wetenschappen, Netherlands Bioinfomatics Centre (NBIC) en
het Netherlands Genomics Initiative (NGI) hebben 2,3 miljoen euro
toegekend voor onderzoek in Computational Life Sciences (CLS). De vijf
projecten ontwikkelen modellen om biologische netwerken, zoals een
zenuwstelsel, celproces of eiwitreactie, mee te analyseren. Deze
unieke samenwerking tussen biologen, wiskundigen en informatici moet
nieuwe biologische inzichten opleveren.
De hoeveelheid biologische data, bijvoorbeeld over het genoom, nemen
exponentieel toe. Deze enorme schat aan informatie maakt het mogelijk
om op een systematische manier experimenten te ontwerpen, patronen te
vinden en modellen te maken. Door analysemethoden uit (bio)informatica
en (bio)wiskunde toe te passen bij de integratie van de biologische
dataverzamelingen ontstaan er nieuwe (wetenschappelijke) inzichten.
Het CLS-programma haakt in op deze ontwikkeling. De projecten
ontwerpen nieuwe concepten en technieken om biologische netwerken te
bestuderen.
Toekenningen
In totaal ontving Exacte Wetenschappen, de coördinator van het
programma, 41 voorstellen. Vijf projectenvoorstellen werden als
excellent beoordeeld en vervolgens toegekend. Het betreft:
* Neuronal Netwerk Formation through Reciprocal Interacties between
Activity and Structure, hoofdaanvrager: Dr. A. van Ooyen (VU)
Om meer inzicht te krijgen in de structuur en het functioneren van
het zenuwnetwerk. ontwikkelen de onderzoekers nieuwe
computermodellen van het zenuwnetwerk. Uniek is dat deze
modelstructuur veranderlijk is onder invloed van elektrische
activiteit, zoals aangenomen in de werkelijke situatie. Nieuwe
statistische methodes vergelijken de uitkomsten vervolgens met het
zenuwnetwerk in de hersenen.
* Understanding hierarchical and metabolic regulation of metabolic
networks through Bayesian constraint modelling, hoofdaanvrager:
Dr. B. Teusink (NIZO Food Reserach)
Aan de hand van de analyse van twee micro-organismen ontstaat meer
begrip over de regulatie binnen een netwerk van reacties in een
cel. Computermodellen zorgen dat diverse respons-scenario's
doorgerekend kunnen worden bij een verstoring in de cel.
* From spiking neurons to brain waves, hoofdaanvrager: Prof. dr.
C.C.A.M. Gielen (RUN)
Aan de hand van wiskundige analyses en computersimulaties
bestuderen de onderzoekers de functionele rol en ontstaan van
gamma oscillaties in de neuronen. De resultaten vergelijken ze
vervolgens met de gegevens uit EEG van patiënten met focale
epilepsie.
* Modellingen gene networks in synaptic computation: A Bayesian
pertubation approach, hoofdaanvrager: Dr. L.N. Cornelisse (VU)
Een gen-netwerk model geeft en kwantitatieve beschrijving van de
informatieoverdracht op synapsniveau en daarmee meer inzicht hoe
de hersenen informatie verwerken. Hierbij wordt Bayesiaanse
kansberekening gebruikt, om te onderzoeken welke modellen het
beste de experimentele data kunnen beschrijven.
* Microbial ecosystems and multiple environment stoichiometric
analyses, hoofdaanvrager: Dr. ing. F.J. Bruggeman (NISB)
Gebruikmakend van de DNA-code van een micro-organisme, wil het
project meer inzicht geven in het aanpassend vermogen van het
micro-organisme en zijn individuele rol in de microbiële
gemeenschap en de invloed van de gemeenschap op het
micro-organisme.
Vervolg
Voor het CLS-programma stellen de financiers in totaal een bedrag van
4,82 miljoen euro beschikbaar, waarvan twee competitierondes worden
gefinancierd.
In het najaar van 2008 volgt de tweede ronde waarvoor 2,5 miljoen euro
beschikbaar is. De oproep voor subsidieaanvragen hiervoor verschijnt
dit voorjaar.
Meer informatie:
* Marjolein Schlarmann (voorlichter Exacte Wetenschappen): +31 (0)70
344 0914, schlarmann@nwo.nl
Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek