(françois) alako: "(âknowledge discoveryâ) in de moleculaire biologie
met behulp van bioinformatica technieken"
Dhr. B.F.T. (François) Alako:
"(âknowledge discoveryâ) in de moleculaire biologie met behulp van
bioinformatica technieken"
1 feb 2008 16:00
Onderdeel: Wageningen Universiteit
Locatie: Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Organisatie: Wageningen Universiteit
Promotor: prof.dr. J.A.M. Leunissen (Bio-informatica)
In dit proefschrift worden verschillende benaderingen beschreven om de
exponentieel groeiende data stroom in de levenswetenschappen te
exploiteren. Twee velden uit de moleculaire biologie worden
aangesproken, de sequentie analyse en tekst analyse.
Het eerste onderwerp richt zich op het probleem van de verwantschap
van eiwitten, vooral wanneer de onderlinge overeenkomsten erg gering
zijn. Hiervoor is een visualisatie programma ontwikkeld dat sequentie
alignment, eiwit domein voorspelling en fylogenie combineert.
Het tweede hoofdonderwerp van dit proefschrift, text mining, spreekt
het probleem aan hoe een zoekvraag in de literatuur zo efficiënt en
eenduidig mogelijk geformuleerd kan worden. Hierbij wordt in het
bijzonder het probleem van de gen-symbool ambiguïteit geadresseerd:
50% van de gen-symbolen is niet eenduidig, en kan dus meer dan een gen
of eiwit familie aanwijzen. De nieuw ontwikkelde methode kan door
gebruik te maken van tekst clustering en taxonomische informatie dit
probleem in vrijwel alle gevallen eenduidig oplossen.
Titel proefschrift: "An integrative algorithmic approach towards
knowledge discovery in Bioinformatics"
Meer over dit onderwerp
Directe internet uitzending van de promotie