Nieuw lab voor visualisatie en analyse grote hoeveelheden gegevens
Op 13 december wordt het eerste Nederlandse e-BioScience Laboratorium (kortweg e-BioLab) geopend op het Science Park Amsterdam. Het e-BioLab biedt wetenschappers de mogelijkheid om grote hoeveelheden onderzoeksgegevens, zoals bijvoorbeeld geproduceerd in genomicsonderzoek, te visualiseren en gezamenlijk te analyseren.
Het e-BioLab is een samenwerking tussen de Universiteit van Amsterdam (UvA), ICT-dienstencentrum SARA en het Nationaal instituut voor subatomaire fysica (Nikhef). Het lab is met een hoge bandbreedte verbonden met het wereldwijde computationele Grid (geheel van aan elkaar gekoppelde computers en netwerken die ieder een deel van een complexe berekening uitvoeren). Hierdoor kunnen uiterst ingewikkelde berekeningen worden gemaakt en complexe beelden worden geproduceerd.
Het 'droge' laboratorium, waar de resultaten van experimenten in een 'nat' lab worden verwerkt en verder geanalyseerd, is uitgerust met een groot hoge-resolutie tiled display (38 megapixel). Met dit beeldschermcluster kunnen zeer grote afbeeldingen (van bijvoorbeeld moleculen) geheel, of veel kleine plaatjes tegelijkertijd gevisualiseerd worden.
Het e-BioLab is gebouwd om wetenschappers uit verschillende disciplines de mogelijkheid te geven samen te werken aan grote biologische en biomedische genomicsprojecten door middel van computerexperimenten. Daarom is het lab ook voorzien van allerlei technische snufjes, zoals een groot plasmascherm met touchscreen, die helpen bij deze experimenten.
Het e-BioLab is ontwikkeld binnen de interdisciplinaire projecten Virtual Lab for e-Science van de UvA en BioAssist van het Netherlands Bioinformatics Centre (NBIC), die ICT ontwikkelen ter ondersteuning van onderzoek in de levenswetenschappen. Op open dagen, zoals de UvA Open Dag op 8 maart 2008, zal het lab worden opengesteld voor het publiek.
Universiteit van Amsterdam
Universiteit van Amsterdam