Rijksuniversiteit Groningen
Computersimulaties van activatie receptoren
Date: September 11, 2006
Aan de buitenzijde van cellen zitten eiwitten, die bekend staan als receptoren. Deze stellen de cel in staat informatie te vergaren omtrent de omgeving waarin zij verkeert en zich aan te passen aan de omstandigheden. De receptoren vormen ook de belangrijkste aangrijpingspunten voor geneesmiddelen. De mechanismen die betrokken zijn bij stimulatie van deze receptoren zijn echter nog grotendeels onbekend. Dit terwijl kennis van deze mechanismen van grote waarde is voor de ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen. Tsjerk Wassenaar onderzocht hoe stimulatie van de delen van de receptor aan de buitenzijde van de cel veranderingen teweeg kan brengen aan de binnenzijde. Deze mechanismen zijn niet of nauwelijks experimenteel te bepalen, maar door middel van computersimulaties heeft Wassenaar ze in kaart weten te brengen. Met name bestudeerde hij een klasse van receptoren die uit verschillende onderdelen bestaan. Een voor de hand liggend mechanisme van activatie is de samenkomst van de verschillende onderdelen onder invloed van een stimulus. Wassenaar toonde echter aan dat de onderlinge stand van de verschillende delen een minstens even belangrijke rol speelt en dat de activatie van deze receptoren tot stand wordt gebracht door een verandering in die relatieve positie. Daarnaast speelt mogelijk de remmende invloed die de stimulus heeft op de beweeglijkheid van de atomen een rol in de activatie. Naast deze meer concrete resultaten heeft zijn onderzoek verschillende methodische bijdragen geleverd aan het vakgebied van de moleculaire dynamica.
Tsjerk Wassenaar (Dokkum, 1977) studeerde Farmacie aan de RUG, waar hij vervolgens zijn promotieonderzoek verrichtte bij de vakgroep Moleculaire dynamica. Per 1 november 2006 zal hij werkzaam zijn als post-doctoraal onderzoeker in het Bijvoet Centrum van de Universiteit van Utrecht. /FC
Datum en tijd
11 september 2006, 14.45 uur
Promovendus
T.A. Wassenaar
Proefschrift
Molecular dynamics of sense and sensibility in processing and analysis of data
Promotor
prof.dr. A.E. Mark
Faculteit
wiskunde en natuurwetenschappen
Plaats
Aula Academiegebouw, Broerstraat 5, Groningen
Informatie
T.A. Wassenaar, tel. (050) 363 4336, e-mail t.a.wassenaar@rug.nl (werk), tel. (0511) 47 65 71 (privé)
Last modified: August 30, 2006 16:00