Proteomics onderzoek leidt tot betere diagnostiek kanker
Proteomics, de grootschalige kwantitatieve analyse van eiwitten, zal
binnen tien jaar leiden tot betere diagnostiek van kanker. Het Cancer
Center Amsterdam zet fors in op de verdere ontwikkeling en klinische
toepassing van dit veelbelovende onderzoeksveld. Het heeft daartoe
ondermeer twee massaspectrometers ter beschikking. Hiermee kunnen
eiwitten, de echte gangmakers in een cel, op grote schaal en heel snel
worden geanalyseerd. De massaspectrometers en de benodigde
ondersteunende apparatuur zijn door Philips gefinancierd.
Een massaspectrometer meet de massa van elektrisch geladen moleculen.
De nieuwste generatie massaspectrometers, zoals die voor het CCA zijn
aangeschaft, is razendsnel, zeer gevoelig en nauwkeurig. Deze
apparatuur kan in één meting honderden eiwitten tegelijk vangen.
Bovendien kunnen de eiwitten worden geïdentificeerd aan de hand van
brokstukken die in een botskamer zijn gegeneerd en vergeleken worden
met de informatie in sequentie databanken. De massaspectrometers zijn
daarmee bij uitstek geschikt om eiwitmassa profielen in kaart te
brengen in complexe biologische monsters zoals bloed.
In het proteomics onderzoek van het CCA staat het opsporen van de
veranderingen in de eiwitmassa profielen in bloed- en weefselbiopten
van patiënten met kanker centraal. Specifieke eiwitten of
eiwitcombinaties kunnen namelijk worden ontwikkeld tot een
diagnostische toepassing of gebruikt worden bij het bepalen van het
effect van behandeling. Hierbij zou het eiwit- massapatroon zelf of de
eiwitten die zijn geïdentificeerd en aan de basis van een veranderd
piekpatroon liggen als biomarker kunnen fungeren. Identificatie van
veranderde eiwitten geeft ook inzicht in het ontstaan van kanker of
het effect van kankermedicatie.
De meerwaarde van de setting in het CCA is de combinatie van de meest
geavanceerde apparatuur met samenwerking tussen experts uit
disciplines als biochemie, analytische chemie, informatica en de
geneeskunde. Door de nabijheid van de kliniek zijn de lijnen tussen
medici en onderzoekers kort. De integratie van disciplines zal leiden
tot een systeem biologische benadering waarin de op het individu
toegesneden diagnose en behandeling mogelijk wordt.
Het CCA is geïntegreerd in VU medisch centrum. Het oncologisch
onderzoek van VUmc behoort al lange tijd tot de wereldtop. Daarnaast
verzorgt het topreferente en topklinische zorg aan patiënten met
kanker. Het CCA wordt deels met private middelen gefinancierd
Vrije Universiteit Amsterdam