Erasmus MC
16-09-2005: Samenwerking Erasmus MC,
Rabobank en IBM in GRID-technologie
Ongebruikte computercapaciteit ingezet voor medisch-wetenschappelijk
onderzoek
Erasmus MC heeft in samenwerking met Rabobank en IBM ongebruikte
computercapaciteit ingezet voor medisch-wetenschappelijk onderzoek.
Dit is de eerste niet-commerciële samenwerking van Nederlandse
bedrijven op dit gebied. Met het gezamenlijke initiatief 'Grid2Do'
kunnen ingewikkelde berekeningen sneller worden gedaan, door
verschillende computers tegelijkertijd kleine pakketjes informatie te
laten verwerken.
Grid is een technologie die een virtueel, samenwerkend geheel over
internet kan verzorgen met resources zoals data, computercapaciteit,
apparatuur en toepassingen. In het Erasmus MC is in augustus 2003
gestart met het project Grid2Do. Bij dit project levert de Rabobank de
computercapaciteit en IBM de kennis. In tests is aangetoond dat Grid
technologie succesvol kan worden toegepast voor onderzoek naar
osteoporose en neurodegeneratieve ziekten (zoals bijvoorbeeld
Alzheimer).
Door Grid-technologie 100x sneller
Bij Grid wordt de gevraagde informatie opgedeeld in pakketjes en die
worden vervolgens door verschillende computers uitgerekend. Hierdoor
kan de verwerkingstijd met bijna een factor 100 omlaag: berekeningen
die normaal zes uur duren, kunnen met de Grid- technologie worden
goedkoper, omdat er gebruik kan worden gemaakt van de capaciteit van
bestaande computers.
Praktijkvoorbeeld
De scanner-apparatuur in ziekenhuizen verbetert, waardoor met een
kortere scantijd betere beelden kunnen worden gemaakt van delen van
het menselijk lichaam. Dit heeft een enorme invloed op onderzoek naar
ziekteprocessen en op de diagnose en behandeling van patiënten. Het
gevolg is wel dat er steeds meer en steeds grotere beelddatasets
gemaakt worden. Om alle informatie uit die beelden op een efficiënte
manier te verwerken, is de hulp van computertechnologie onontbeerlijk.
Voor sommige, vaak drie- dimensionale, toepassingen kan de rekentijd
oplopen tot uren of dagen. Hetzelfde geldt voor medisch en moleculair
onderzoek waarbij steeds grotere gegevensbestanden verkregen worden
die aan elkaar gekoppeld en geanalyseerd moeten worden
(bioinformatica). Door ongebruikte computercapaciteit in te zetten kan
men tijd winnen en kosten besparen.
terug