Meer informatie: dienst Interne en Externe Communicatie, tel. 071-5273282
Woensdag 23 februari 14.15 uur
Christiaan V. Henkel
Experimental DNA computing
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Promotoren: prof.dr. H.P. Spaink, prof.dr. G. Rozenberg, prof.dr.
Th.H.W. Bäck
Samenvatting uit het boek
Digitaal DNA
DNA computers zijn niets nieuws. Levende cellen gebruiken al miljarden
jaren DNA en andere moleculen voor informatieopslag en verwerking. Wel
nieuw zijn pogingen met behulp van DNA abstracte problemen op te
lossen. DNA is erg klein, en dus kan er in theorie een enorme
hoeveelheid rekenwerk worden gedaan met een minieme hoeveelheid
materiaal. Bovendien kunnen bewerkingen worden toegepast op miljarden
moleculen tegelijkertijd een computer met miljarden eenvoudige
parallelle processors. Aan de andere kant is het misschien wel
interessanter om moleculaire computers te bouwen met een biologische
interface. Zulke systemen zouden kunnen worden ingezet voor
biomedische toepassingen, bijvoorbeeld in een soort logische
gentherapie.Henkel beschrijft de uitvoering van een aantal
berekeningen met DNA. De opgeloste problemen zijn nog erg eenvoudig,
bijvoorbeeld een logisch satisfiability probleem met vier variabelen
(een 4-bits moleculaire computer). De moleculair biologische
uitvoering is echter allesbehalve triviaal. In dit geval werd het
probleem gecodeerd in enkelstrengs DNA. De berekening bestaat uit het
spontaan vormen van dubbelstrengs DNA, afhankelijk van de basenpaar
informatie. De experimentele uitdaging is, dit proces digitaal te
laten verlopen voor alle 112 mogelijke combinaties. Uiteindelijk is
het gelukt een foutloze uitkomst te bepalen met behulp van een
geavanceerde fluorescentie spectroscopie techniek.
Oraties en promoties vinden plaats in het Academiegebouw, Rapenburg
73.
Informatie: afdeling wetenschapsvoorlichting van de Universiteit
Leiden: 071-5273282 of wetenschap@ics.leidenuniv.nl.
Voor inlichtingen over promoties en oraties in de faculteit
Geneeskunde kunt u contact opnemen met het LUMC: 071-5268005