Rijksuniversiteit Groningen

Beter rekenen aan metaaleiwitten

Eiwitten waarin metaalatomen voorkomen, spelen een rol in verschillende elementaire processen in mens, dier en plant. Omdat eiwitten grote moleculen zijn, kunnen ze (nog) niet met kwantummechanica worden beschreven. Chemici passen daarom minder nauwkeurige beschrijvingsmethoden toe, methoden die overigens wel voldoende zijn om de meest belangrijke processen te begrijpen waarin de eiwitten betrokken zijn. De 'force field'-methode is bijvoorbeeld in het algemeen goed geschikt voor het beschrijven van dynamische eigenschappen van het eiwit. Uitgezonderd zijn echter de metaaleiwitten, want daarbij is de force field aanpak moeilijk generaliseerbaar. Marcel Swart zocht naar een oplossing voor dit probleem. Hij gebruikte de Density Functional Theory (een kwantummechanische methode) om het force field rekenen aan te scherpen. Met als voorbeeld het actieve centrum van azurine (een kopereiwit) testte hij of dit tot verbetering leidt. Dat blijkt het geval. Swart concludeert dat de methode goede resultaten geeft bij de beschrijving van het actieve centrum en bij de bestudering van reactiemechanismen. /JS

Marcel Swart (Zutphen, 1971) studeerde scheikunde in Groningen. Hij voerde het onderzoek, gefinancierd met fondsen van NWO en Unilever, uit bij de vakgroep Theoretische Chemie van de RUG. Swart werkt op het ogenblik als post-doc bij de groep Organische en Anorganische Chemie van de Vrije Universiteit.

Datum en tijd

dinsdag 10 september 2002, 13.15 uur

Promovendus

M. Swart, tel. (020)444 74 77, fax (020)444 74 88, e-mail: swart@chem.vu.nl (werk)

Proefschrift

Density functional theory applied to copper proteins

Promotores

prof.dr. J.G. Snijders, prof.dr. H.J.C. Berendsen, prof.dr. G.W. Canters

Faculteit

wiskunde en natuurwetenschappen

Plaats

Aula Academiegebouw, Broerstraat 5, Groningen

Promotie