Rijksuniversiteit Groningen
Beter rekenen aan metaaleiwitten
Eiwitten waarin metaalatomen voorkomen, spelen een rol in
verschillende elementaire processen in mens, dier en plant. Omdat
eiwitten grote moleculen zijn, kunnen ze (nog) niet met
kwantummechanica worden beschreven. Chemici passen daarom minder
nauwkeurige beschrijvingsmethoden toe, methoden die overigens wel
voldoende zijn om de meest belangrijke processen te begrijpen waarin
de eiwitten betrokken zijn. De 'force field'-methode is bijvoorbeeld
in het algemeen goed geschikt voor het beschrijven van dynamische
eigenschappen van het eiwit. Uitgezonderd zijn echter de
metaaleiwitten, want daarbij is de force field aanpak moeilijk
generaliseerbaar. Marcel Swart zocht naar een oplossing voor dit
probleem. Hij gebruikte de Density Functional Theory (een
kwantummechanische methode) om het force field rekenen aan te
scherpen. Met als voorbeeld het actieve centrum van azurine (een
kopereiwit) testte hij of dit tot verbetering leidt. Dat blijkt het
geval. Swart concludeert dat de methode goede resultaten geeft bij de
beschrijving van het actieve centrum en bij de bestudering van
reactiemechanismen. /JS
Marcel Swart (Zutphen, 1971) studeerde scheikunde in Groningen. Hij
voerde het onderzoek, gefinancierd met fondsen van NWO en Unilever,
uit bij de vakgroep Theoretische Chemie van de RUG. Swart werkt op het
ogenblik als post-doc bij de groep Organische en Anorganische Chemie
van de Vrije Universiteit.
Datum en tijd
dinsdag 10 september 2002, 13.15 uur
Promovendus
M. Swart, tel. (020)444 74 77, fax (020)444 74 88, e-mail:
swart@chem.vu.nl (werk)
Proefschrift
Density functional theory applied to copper proteins
Promotores
prof.dr. J.G. Snijders, prof.dr. H.J.C. Berendsen, prof.dr. G.W.
Canters
Faculteit
wiskunde en natuurwetenschappen
Plaats
Aula Academiegebouw, Broerstraat 5, Groningen
Promotie