persbericht / nr. 2001-14, 19 juli 2001
Wageningen UR publiceert grootste genetische code van een diervirus
Aanpak wereldwijde epidemie van White Spot Syndrome Virus (WSSV) in
garnalen
Onderzoekers van het Laboratorium voor Virologie van Wageningen
Universiteit en de Greenomics(TM)-groep van Plant Research
International publiceren 19 juli 2001 in het gezaghebbende
tijdschrift `Virology' de volledige genetische code van een virus
dat een wereldwijde epidemie veroorzaakt in de garnalenkwekerij:
het White Spot Syndrome Virus (WSSV). De genetische code is de
grootste die ooit voor een diervirus is gepubliceerd: 292.976
basenparen. De onderzoekers hopen dat dankzij deze informatie
nieuwe methoden ontwikkeld kunnen worden voor de bestrijding van de
ziekte.
Microscoopfoto van WSSV virus. (bron: Wageningen Universiteit,
Laboratorium voor Virologie)
De economische waarde van de wereldwijde garnalenkwekerij wordt
geschat op 2 miljard dollar per jaar. Vooral in Azië en Zuid-Amerika
zijn grote kwekerijen, van soms wel duizenden hectares, die
werkgelegenheid bieden aan honderdduizenden mensen.
Het WSSV is een grote bedreiging voor de kapitaalintensieve
garnalenkwekerij en de kwekerij van andere geleedpotige schaaldieren
zoals kreeften. Het virus stak voor het eerst de kop op in Zuidoost
Azië in het begin van de jaren '90. Het virus heeft zich daarna
razendsnel verspreid. In 1999 is praktisch de hele garnalensector van
Equador weggevaagd, en het virus bedreigt nu ook Mexico en de USA. In
december 2000 is het voor het eerst ook in Australië gesignaleerd.
Daarnaast vormt het ook een grote bedreiging van het ecosysteem
doordat ook vele andere ongewervelde diersoorten, die onderdeel zijn
van de voedselketen, kunnen worden aangetast.
Wageningen UR analyseerde de genetische code van het virus, omdat het
virus paste in hun onderzoek naar de verwantschap binnen een bepaalde
groep virussen die alleen bij insecten en kreeftachtigen voorkomt: de
baculovirussen.
Op basis van de genetische code zijn de onderzoekers echter tot de
conclusie gekomen dat het WSSV tot een heel andere virusgroep behoort.
Van de plaatsen op het DNA die als vermoedelijke genen zijn
aangewezen, komt maar 5% overeen met de genen die eerder gevonden zijn
bij baculovirussen. Binnen deze groep is gemiddeld 50% van de genen
ook aanwezig bij de groepgenoten.
De nieuwe virusgroep heeft als voorlopige naam `Nimaviridae' gekregen
vanwege het karakteristieke staartje van het virus.
De onderzoekers vonden ook een opvallend groot gen in de genetische code van het garnalenvirus: 18.234 basenparen. Er bestaat nog geen duidelijkheid over de rol en het belang van dit gen.
De Wageningse onderzoekers hopen dat de opgehelderde genetische code nieuwe aanknopingspunten biedt voor een betere of geheel nieuwe de aanpak van het virusprobleem in de garnalenteelt.